Savinase - Enzymkinetik - Opgaver i Kemi

Side 1

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 1 af 6

Bioteknologi aflevering nr. 6 – Savinase

På figur 1 ser vi et protein. Savinase er altså et protease da det spalter protein. Et protein er opbygget af aminosyrer som er bundet sammen med peptidbindinger, som er en binding i mellem en carboxylsyre og en aminosyre. På figuren kan vi se at der indgår vand (H O), hvilket betyder at

2 det er en hydrolyse. Altså spalter Savinase peptidbindingen ved at hydrolysere den (optage vand), og savinase tilhører derfor enzymgruppen hydrolaser.

Savinase er altså derfor rigtig godt at have i vaskemiddel. Pletter af blod, kød, æg og andre proteinrige pletter vil være lette at få af, da savinase spalter proteiner og på den måde får pletterne til at forsvinde.

x

Kommentar [A1]: godt

Side 2

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 2 af 6

Side 3

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 3 af 6

                                         Δ A
Vi ved at reaktionshastigheden er givet ved formlen: v = , hvor [ ] A er den aktuelle
                                          Δ t

[ ] koncentration af stoffet A.

For at finde ændringen i koncentrationen, bruger vi Lambert Beers lov, som ses i boksene nedenfor:

Vi har tidligere fået at vide at den molare absorptionskoefficient er på^{L}_{⋅}_{cmmol} 10500 og at

kuvettebredden er 1,0 cm. Derfor kan vi nu finde ændringen i koncentrationen ved at aflæse to

Side 4

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 4 af 6

steder på den lineære graf i figur 2. Vi regner koncentrationen ud ved tiden 0 min og ved tiden 0,8 min. Se tegningen nedenfor:

Koncentrationen til t = 0:

     A
      0
[ ] A 0 = =              =  M
  0

⋅ 0,110500 cm

⋅ cmmol

L

⋅ l

0 ε

Koncentrationen til t = 0,8:

      A 9,
       0
[ ] A 000048,0 = =         =       M
   9,0
       ⋅ l

⋅ 0,110500 cm

⋅ cmmol

L

5,0 M ε

                                   Δ A
                                                                                        -5
Vi finder nu hastigheden ud fra grafen: v = = =                      x                10 M/min ?
                                    Δ t

[ ] − 0000048,0_{00006,0_{min}} MM M
− min0min8,0

                                                    MM
                                                  − 6
Steady state initialhastigheden v var i virkeligheden 5,59 ⋅= 105,59
                                        min        min

µ

Vi har derfor en procentvis afvigelse på^{min} =⋅ %84,0%100

min

0000595,0 min

00006,0 − 0000595,0

M

MM

                                                                            M
Vi har altså ud fra grafen på figur 2, vist at steady state initialhastigheden i forsøg 5 var 5,59 ,
                                                                          min

µ med en afvigelse på 0,84 % mere end den rigtige værdi.

Vi kan aflæse V på grafen, der hvor vi ser at hastigheden v ikke bliver højere. Derefter kan vi ud max fra ½V max M max på 2.-aksen ramme grafen og finde K på 1.-aksen. Se figur 3B på næste side, hvor V

,

½V og K er angivet med rød.

max M

                     M
Vi kan se at V =   0,66
                    min

max µ

Og K = 35,0_{mM}^{S}

M

[ ]

Kommentar [A2]: fpår du faktisk 60,0

Side 5

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 5 af 6

                                      V
                                       max
k  finder vi ved hjælp af formlen: k =
                                  cat

cat

[ ] E

Da vi kender V skal vi først finde enzymkoncentrationen. Vi ved at koncentrationen af enzym-max stamopløsningen var 2nM. Da vi tager 100

L µ enzymopløsning. skal vi gange med dette.

For at finde enzymkoncentrationen skal vi finde ud af hvor meget dette udgør af den samlede volumen, som vi finder i tabel 1, forsøg 5:

Samlede volumen = 700 L + 700 L +100 L = 1500 L

µ µ µ µ

Enzymkoncentrationen er derfor:

                          − 10
[ ] E =                 ⋅= 103333,1 M

1500 L

⋅⋅ 100102 LnM

− 9

µ µ

   ==
            − 10
[ ] E    ⋅ 103333,1 M

M

V_{max}
k_{cat}

min

00,66 µ

= 495001 substratmolekyler pr. min. =       = 8250,02 substratmolekyler pr. sekund.
                                   sek/min 60

1-min 495001

Formateret: Hævet skrift

Side 6

Odder Gymnasium [navn fjernet] 3.y

Fag: Bioteknologi, Afleveringsdato: d. 26/10 2011 Side 6 af 6

x

Litteraturlisten:

- Bugge, Carsten m.fl.: Bioteknologi 2. Side 66-69. 1. udg. Nucleus, 2010. (Bog)

Kommentar [A3]: fint – som supplement kunne man

1)Sammenligne værdien kcat med andre værdier i bogens figur 29

2)Have benyttet et Lineweaver-Burk plot.